Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX48

Zcchc10, Zinc finger CCHC domain-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc10Q9CX48 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zcchc10Q9CX48 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zcchc10Q9CX48 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zcchc10Q9CX48 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms