Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cxxc1Q9CWW7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxxc1Q9CWW7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cxxc1Q9CWW7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276.7 ms