Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NubplQ9CWD8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NubplQ9CWD8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms