Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Sycp2Q9CUU3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Sycp2Q9CUU3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Sycp2Q9CUU3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
Sycp2Q9CUU3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Sycp2Q9CUU3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Sycp2Q9CUU3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
Sycp2Q9CUU3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Sycp2Q9CUU3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms