Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otud1Q9CUB6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Otud1Q9CUB6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud1Q9CUB6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud1Q9CUB6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms