Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CRC3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CRC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q9CRC3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CRC3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CRC3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q9CRC3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CRC3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRC3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CRC3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9CRC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9CRC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms