Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PpidQ9CR16 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PpidQ9CR16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PpidQ9CR16 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PpidQ9CR16 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms