Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccer1Q9CQL2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccer1Q9CQL2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccer1Q9CQL2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms