Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmed6Q9CQG0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmed6Q9CQG0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed6Q9CQG0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed6Q9CQG0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms