Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC8

Spg21, Maspardin, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg21Q9CQC8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spg21Q9CQC8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spg21Q9CQC8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spg21Q9CQC8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spg21Q9CQC8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.6 ms