Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc5Q9CQA1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc5Q9CQA1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc5Q9CQA1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc5Q9CQA1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms