Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa3Q9CQ91 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufa3Q9CQ91 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms