Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4921530L21RikQ9CQ47 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4921530L21RikQ9CQ47 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4921530L21RikQ9CQ47 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4921530L21RikQ9CQ47 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms