Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930519G04RikQ9CPT7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930519G04RikQ9CPT7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930519G04RikQ9CPT7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms