Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpl17Q9CPR4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpl17Q9CPR4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpl17Q9CPR4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpl17Q9CPR4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms