Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scd3Q99PL7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scd3Q99PL7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scd3Q99PL7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scd3Q99PL7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scd3Q99PL7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scd3Q99PL7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms