Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NsmfQ99NF2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NsmfQ99NF2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NsmfQ99NF2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NsmfQ99NF2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms