Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ms4a6cQ99N08 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a6cQ99N08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a6cQ99N08 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a6cQ99N08 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 891.6 ms