Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ms4a6dQ99N07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6dQ99N07 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a6dQ99N07 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms