Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pramel1Q99MW3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel1Q99MW3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pramel1Q99MW3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pramel1Q99MW3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms