Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atp1b4Q99ME6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atp1b4Q99ME6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Atp1b4Q99ME6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atp1b4Q99ME6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Atp1b4Q99ME6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Atp1b4Q99ME6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms