Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdpd3Q99LY2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdpd3Q99LY2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gdpd3Q99LY2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms