Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nus1Q99LJ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nus1Q99LJ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nus1Q99LJ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nus1Q99LJ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms