Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC9

Pex6, Peroxisome assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex6Q99LC9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pex6Q99LC9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex6Q99LC9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pex6Q99LC9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms