Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cds2Q99L43 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds2Q99L43 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds2Q99L43 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms