Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pagr1aQ99L02 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pagr1aQ99L02 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pagr1aQ99L02 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pagr1aQ99L02 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms