Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PpifQ99KR7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpifQ99KR7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PpifQ99KR7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms