Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pacsin3Q99JB8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pacsin3Q99JB8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pacsin3Q99JB8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacsin3Q99JB8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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