Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Foxp3Q99JB6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxp3Q99JB6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxp3Q99JB6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxp3Q99JB6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms