Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc6Q924W5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc6Q924W5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smc6Q924W5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc6Q924W5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms