Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ripply3Q924S9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ripply3Q924S9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ripply3Q924S9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ripply3Q924S9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ripply3Q924S9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ripply3Q924S9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms