Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim59Q922Y2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim59Q922Y2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim59Q922Y2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim59Q922Y2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms