Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf3Q920N1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms