Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SncbQ91ZZ3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SncbQ91ZZ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SncbQ91ZZ3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SncbQ91ZZ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms