Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx18Q91ZR2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx18Q91ZR2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx18Q91ZR2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms