Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZF4

Ctsq, Cathepsin Q, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsqQ91ZF4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CtsqQ91ZF4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CtsqQ91ZF4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CtsqQ91ZF4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtsqQ91ZF4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtsqQ91ZF4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms