Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PccaQ91ZA3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PccaQ91ZA3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PccaQ91ZA3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PccaQ91ZA3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms