Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha1Q91Y21 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha1Q91Y21 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha1Q91Y21 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms