Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdha5Q91Y15 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha5Q91Y15 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdha5Q91Y15 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdha5Q91Y15 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms