Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdha8Q91Y12 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdha8Q91Y12 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdha8Q91Y12 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms