Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prb1Q91X93 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prb1Q91X93 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prb1Q91X93 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prb1Q91X93 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prb1Q91X93 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prb1Q91X93 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms