Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snx11Q91WL6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx11Q91WL6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx11Q91WL6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx11Q91WL6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms