Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trub2Q91WG3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trub2Q91WG3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trub2Q91WG3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trub2Q91WG3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms