Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Klc3Q91W40 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Klc3Q91W40 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Klc3Q91W40 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Klc3Q91W40 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Klc3Q91W40 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Klc3Q91W40 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms