Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU1

Yipf1, Protein YIPF1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf1Q91VU1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Yipf1Q91VU1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Yipf1Q91VU1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Yipf1Q91VU1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Yipf1Q91VU1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms