Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam3cQ91VU0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam3cQ91VU0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam3cQ91VU0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam3cQ91VU0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fam3cQ91VU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam3cQ91VU0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.8 ms