Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cabp4Q8VHC5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cabp4Q8VHC5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cabp4Q8VHC5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cabp4Q8VHC5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cabp4Q8VHC5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms