Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ4

Nle1, Notchless protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nle1Q8VEJ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nle1Q8VEJ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nle1Q8VEJ4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nle1Q8VEJ4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nle1Q8VEJ4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms