Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Ttc39cQ8VE09 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc39cQ8VE09 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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Ttc39cQ8VE09 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39cQ8VE09 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39cQ8VE09 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc39cQ8VE09 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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Ttc39cQ8VE09 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39cQ8VE09 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Ttc39cQ8VE09 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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Ttc39cQ8VE09 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc39cQ8VE09 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Ttc39cQ8VE09 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Ttc39cQ8VE09 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Ttc39cQ8VE09 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Ttc39cQ8VE09 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc39cQ8VE09 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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Ttc39cQ8VE09 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc39cQ8VE09 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc39cQ8VE09 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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