Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Apol9aQ8VDU3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apol9aQ8VDU3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apol9aQ8VDU3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apol9aQ8VDU3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms